支原体阴性通常表示检测未发现支原体感染，可能与检测时间过早、样本采集不当、检测方法局限或自愈等因素有关。若存在相关症状，需结合临床表现综合判断。
1、检测时间过早
支原体感染后需要一定时间才能在体内达到可检测水平。例如，在感染初期或窗口期进行检测，可能因病原体载量不足导致假阴性结果。此时建议在症状出现后1-2周复查以提高准确性。
2、样本采集不当
支原体检测对样本质量要求较高。若采集尿道分泌物、宫颈拭子或尿液时操作不规范，可能导致样本中病原体含量过低。例如，女性患者在月经期采集宫颈样本，可能因血液干扰影响检测结果。
3、检测方法局限
不同检测技术灵敏度存在差异。培养法虽为金标准，但支原体生长缓慢且需要特殊培养基，易出现假阴性；而核酸检测（PCR）敏感性较高，但受试剂质量和扩增条件影响，必要时需采用多种方法联合检测。
4、自愈或治疗后清除
部分免疫功能正常者感染后可能通过自身免疫力清除病原体，例如肺炎支原体引起的上呼吸道感染常呈自限性。此外，若患者已接受阿奇霉素、多西环素等药物治疗，也可能导致病原体被清除而呈现阴性结果。
若检测结果为阴性但存在尿频、咳嗽、白带异常等症状，建议在医生指导下进行衣原体、淋球菌等其他病原体筛查。日常需注意个人卫生，避免不洁性行为，检测前后应严格按照规范进行样本采集和送检。