真菌感染可以通过局部外用药物、口服药物、保持卫生、调整生活习惯以及手术治疗等方式进行根治，具体治疗方案需根据感染部位和严重程度而定。
1、局部外用药物
对于皮肤、指甲等浅表真菌感染，通常首选外用抗真菌药物。酮康唑乳膏、联苯苄唑乳膏等可抑制真菌细胞膜合成，特比萘芬喷雾剂对须癣毛癣菌等皮肤癣菌有杀菌作用。使用时需覆盖整个感染区域及周边正常皮肤2cm范围，足癣患者建议持续用药4周以上。
2、口服药物
顽固性感染或深部真菌病需联合系统用药。伊曲康唑胶囊对念珠菌属和曲霉菌有效，氟康唑片适用于隐球菌性脑膜炎，特比萘芬片对甲真菌病治愈率可达70%以上。肝功能异常者需慎用，用药期间建议每4周监测转氨酶指标。
3、保持卫生
每日用硫磺皂清洗感染部位可破坏真菌生存环境，煮沸消毒贴身衣物能灭活60℃以上的真菌孢子。足癣患者应分开使用指甲剪等个人物品，糖尿病患者需特别注意足部干燥护理。
4、调整生活习惯
穿着纯棉透气衣物可使体表湿度降低30%-50%，避免穿他人鞋袜可减少70%的交叉感染风险。控制血糖在6.1-7.8mmol/L范围内能显著改善糖尿病患者真菌感染治愈率。
5、手术治疗
甲板厚度超过2mm的严重甲真菌病可采用拔甲术，术后联合局部用药可使治愈率提升至85%。肺部真菌球直径超过4cm时需行肺叶切除术，术后需持续抗真菌治疗6-12个月。
建议在皮肤科医生指导下规范用药，治疗期间避免擅自停药。保持患处通风干燥，内衣裤应每日更换并阳光暴晒。糖尿病患者需将空腹血糖控制在7.0mmol/L以下，免疫力低下者可适当补充维生素B族和锌元素增强皮肤屏障功能。若出现肝功能异常或皮疹加重，应立即复诊调整治疗方案。