长期服用二甲基砜可能会引发胃肠道刺激、肝肾负担增加、过敏反应等危害。具体风险与个体差异及服用剂量相关，建议在医生指导下使用。
二甲基砜作为膳食补充剂常用于缓解关节疼痛，但过量或长期使用可能影响消化系统。部分人群服用后会出现恶心、腹胀或腹泻等症状，这与该物质刺激胃黏膜的特性有关。长期摄入可能改变肠道菌群平衡，导致营养吸收异常。
肝肾代谢压力是另一个潜在风险。二甲基砜需通过肝脏转化并经肾脏排出，长期大剂量服用可能造成转氨酶指标异常，对于已有肝肾疾病患者可能加重病情。临床数据显示，每日摄入超过6克可能显著提高肝肾损伤概率。
过敏反应虽不常见但需警惕。个别敏感体质人群可能出现皮肤红疹、瘙痒或呼吸道不适，严重时可能引发过敏性休克。与某些药物联用时可能影响抗凝血剂效果，或增强镇静类药物作用，导致出血风险或中枢神经抑制。
使用二甲基砜前应进行肝功能检测，建议从低剂量开始逐步调整。出现持续性头痛、尿液颜色改变或乏力等症状时应立即停用。特殊人群如孕妇、哺乳期妇女及慢性病患者需严格遵循医嘱，避免擅自长期服用。