季铵盐消毒液对冠状病毒有一定的灭活作用，但需根据具体浓度和使用条件判断其有效性。冠状病毒属于有包膜病毒，季铵盐类消毒剂可通过破坏病毒包膜结构使其失活，不过实际消毒效果受作用时间、溶液浓度和有机物干扰等因素影响。
季铵盐消毒液的杀菌机理主要通过阳离子表面活性剂吸附于微生物表面，改变细胞膜通透性导致胞内物质外流。对于冠状病毒这类脂溶膜病毒，苯扎氯铵等季铵盐成分在推荐浓度下接触10分钟以上可有效灭活病毒。但需注意有机物存在（如血液、分泌物）会明显降低消毒效果，需先清洁污染面再使用。
使用时应严格按照产品说明配制有效浓度，通常家用消毒推荐0.2%-0.5%浓度溶液。喷洒消毒需保证物表完全湿润并维持作用时间不低于5分钟。需避免与阴离子表面活性剂（如普通肥皂）混合使用，否则会产生拮抗作用降低消毒效能。金属器械消毒后应及时擦拭防止腐蚀。
日常防护中建议优先选用卫健委推荐的新型冠状病毒消毒剂，如含氯消毒剂或75%乙醇。季铵盐消毒液更适用于医疗器械、硬质物表等场景的预防性消毒。特殊时期使用消毒剂应做好个人防护，保持环境通风，不同种类消毒剂避免混合存放。