胃间质瘤的良恶性需根据具体病情判断，通常存在潜在恶性风险。多数胃间质瘤表现为潜在恶性或恶性，仅少数为良性，需结合病理检查结果明确诊断。
胃间质瘤的良恶性主要依据肿瘤大小、核分裂像及生长部位综合评估。若肿瘤直径超过2厘米或核分裂像较高，提示恶性可能性较大。此外，位于胃体外的间质瘤恶性风险相对较高。这类肿瘤可能通过血液转移至肝脏或腹腔，需通过影像学检查评估扩散情况。即使初始诊断为良性，也存在后期恶变可能，因此需密切随访。
建议确诊胃间质瘤的患者定期进行胃镜及腹部增强CT检查，监测肿瘤变化。若出现腹痛、消化道出血或短期内体积增大，应及时就诊。治疗方案需根据肿瘤性质制定，必要时通过手术切除或靶向药物控制进展。日常避免刺激性饮食，保持规律作息有助于降低疾病风险。