黄连素片和复方黄连素片的主要区别在于成分组成、适应症及药物作用机制等方面，临床需根据具体病情遵医嘱选用。
黄连素片的主要成分为盐酸小檗碱，属于单一成分制剂，具有广谱抗菌作用，尤其对痢疾杆菌、大肠杆菌等肠道致病菌抑制作用显著。其作用机制是通过抑制细菌DNA复制和蛋白质合成来发挥抗菌效果，临床主要用于治疗细菌性痢疾、胃肠炎等单纯性肠道感染性疾病。
复方黄连素片在盐酸小檗碱基础上添加了中药成分，形成复方制剂。木香具有行气止痛功效，能缓解肠道痉挛；白芍可养血柔肝、缓急止痛；吴茱萸温中散寒。这些成分的协同作用使其在抗菌的同时，更适用于伴有明显腹痛、腹胀、里急后重等症状的肠炎或痢疾，对寒热错杂型腹泻效果更佳。
在药物选择时，若患者仅有单纯性腹泻而无明显腹痛，可考虑使用黄连素片；若伴随腹部绞痛、排便不畅等症状，复方黄连素片更为适宜。需注意两者均可能引起恶心、呕吐等胃肠道反应，过敏体质者慎用。特殊人群如孕妇、哺乳期妇女用药前应咨询医师，避免自行联用其他止泻药物。