肠镜检查通常可以挂消化内科、普通外科或内镜中心，具体需根据医院科室设置而定。若医院未单独设立内镜中心，建议优先选择消化内科或普通外科就诊。
1、消化内科
消化内科是负责胃肠道疾病诊断和治疗的科室，肠镜检查主要用于排查肠道炎症、息肉、肿瘤等病变。患者若存在腹泻、便血、腹痛等消化道症状，或需定期筛查肠癌，可挂消化内科开具检查单并预约时间。部分医院消化内科医生可直接操作肠镜。
2、普通外科
当患者已确诊肠道肿瘤、肠梗阻、肠息肉等需手术干预的疾病时，普通外科医生可能根据病情需要开具肠镜检查单，以便进一步明确病变范围和性质。若检查中发现需手术处理的病灶，外科医生可直接制定后续治疗方案。
3、内镜中心
部分三甲医院设有独立的内镜中心，提供胃肠镜专项检查服务。患者可通过医院官网或导诊台咨询是否开放肠镜专项挂号通道。此类科室通常实行检查-治疗一体化模式，发现息肉等病变时可同步进行内镜下切除。
建议就诊前通过医院官网、电话咨询或导诊台确认科室挂号信息，不同医院的科室设置可能存在差异。检查时需携带既往病历、化验报告等相关资料，以便医生全面评估肠道状况。若存在严重心肺疾病或凝血功能异常等禁忌证，需提前告知医生调整检查方案。