乙脑减毒活疫苗通常安全性较高，其制备工艺和接种流程均经过严格审批及临床试验验证。作为预防乙型脑炎的有效手段，该疫苗在国内外已应用多年，整体耐受性良好，但仍需遵医嘱规范接种。
乙脑减毒活疫苗通过基因技术使病毒毒力减弱，保留免疫原性但失去致病性。大规模接种数据显示，90%以上的接种者未出现明显不良反应。常见局部反应如接种部位红肿通常在48小时内自行消退，少数可能出现低于38.5℃的低热，这些均属于正常免疫应答。疫苗生产需通过WHO预认证，每批次都经过效力、热稳定性和无菌检测。接种前医务人员会评估禁忌证，如免疫缺陷、急性疾病等情况会暂缓接种。冷链运输全程监控保障疫苗活性，接种机构必须具备相应资质。
接种后建议留观30分钟，出现高热或持续不适需及时就医。育龄妇女接种后3个月内应避孕，与其它减毒活疫苗需间隔1个月接种。对鸡蛋过敏者需提前告知医生，虽然现行疫苗工艺已极大降低卵清蛋白残留量。按时完成基础免疫和加强接种可维持长期保护效果，适龄儿童应按照免疫规划程序接种。