胺碘酮严重的副作用可能包括肺毒性、肝损伤、甲状腺功能异常以及心脏相关不良反应，需密切监测并及时处理。长期使用该药物时，需在医生指导下定期进行身体检查，避免严重后果发生。
胺碘酮可能引发肺间质纤维化或肺炎，表现为干咳、呼吸困难甚至呼吸衰竭，严重时可能危及生命。其肝毒性可导致转氨酶升高或急性肝坏死，患者可能出现黄疸、腹痛等症状。该药物还会干扰甲状腺激素代谢，可能诱发甲状腺功能亢进或减退，表现为体重异常变化、心悸或乏力。此外，胺碘酮本身存在致心律失常风险，可能诱发尖端扭转型室速等恶性心律失常事件。
长期用药者需每3-6个月进行胸部CT、肺功能检测及肝功能检查，同时监测甲状腺功能和心电图变化。若出现持续咳嗽、皮肤巩膜黄染、心慌晕厥或视觉异常等症状，应立即停药并就医。用药期间应避免同时使用其他延长QT间期的药物，并注意防晒以减少皮肤光敏反应发生。