胃肠功能紊乱患者通常可遵医嘱使用促胃肠动力药、消化酶制剂、益生菌、抑酸药、止泻药或导泻药等。具体用药需结合患者症状表现及病因进行选择，不可自行盲目使用。
1、促胃肠动力药
这类药物能增强胃肠道蠕动，改善腹胀、早饱等症状。常用药物包括多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等，适用于胃排空延迟或功能性消化不良患者。
2、消化酶制剂
通过补充胰酶、胃蛋白酶等消化酶，帮助分解食物中的蛋白质、脂肪等成分。复方消化酶胶囊、胰酶肠溶胶囊等制剂可缓解因消化酶不足导致的食欲不振、餐后腹胀。
3、益生菌
双歧杆菌三联活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌颗粒等微生态制剂，能调节肠道菌群平衡，改善肠道功能紊乱引发的腹泻、便秘交替症状，尤其适用于抗生素相关性腹泻。
4、抑酸药
对于伴有反酸、烧心等胃酸分泌过多症状者，可选用奥美拉唑肠溶胶囊、雷贝拉唑钠肠溶片等质子泵抑制剂，或铝碳酸镁咀嚼片等抗酸剂中和胃酸。
5、止泻药或导泻药
腹泻为主时可短期使用蒙脱石散吸附毒素；便秘为主者可选用乳果糖口服溶液等渗透性泻药，避免使用刺激性泻药以免加重肠道功能紊乱。
胃肠功能紊乱患者需注意规律饮食，避免暴饮暴食和辛辣刺激食物，保持情绪稳定。若症状持续超过2周或伴有体重下降、便血等报警症状，应及时就医进行胃肠镜等检查排除器质性疾病。所有药物均需在医生指导下规范使用，切忌自行联用多种药物掩盖病情。