阴茎短小一般不会直接影响生育能力，但若存在严重器质性病变或性功能障碍时可能间接影响生育。生育能力主要取决于精子质量、输精管道通畅性以及正常性功能，而非单纯阴茎尺寸。
阴茎长度存在较大的个体差异，多数情况下只要能够完成正常性生活并顺利射精，阴茎短小并不会阻碍受孕。男性生育能力的核心评估指标包括精液常规检查中的精子浓度、活力和形态，这些与阴茎尺寸无直接关联。部分阴茎短小者可能因心理压力导致勃起功能障碍，但通过心理咨询或药物治疗通常可以改善。
若阴茎短小合并先天性畸形（如严重尿道下裂）或外伤导致的器质性损伤，可能影响精液输送功能。此类情况需通过手术修复尿道或矫正解剖结构异常，恢复正常的射精功能。存在性功能障碍者可通过口服磷酸二酯酶抑制剂改善勃起质量，必要时还可采用辅助生殖技术实现生育。
建议有生育困扰的男性及时到生殖医学科就诊，通过精液分析、性激素检测和生殖系统超声等检查明确病因。保持规律作息、避免阴囊高温环境、戒烟限酒等健康生活方式有助于维持正常生育功能。确诊为器质性疾病者应遵医嘱进行规范治疗，多数情况下都能获得满意生育结局。