甘氨酸可以作为抑制性神经递质，但在不同脑区可能发挥不同作用。其在中枢神经系统的功能具有多样性，需结合具体神经通路和受体类型进行分析。
甘氨酸在脊髓和脑干等区域主要作为抑制性神经递质发挥作用。其通过激活甘氨酸受体介导氯离子内流，引发突触后膜超极化，从而抑制神经元兴奋性。这种抑制作用对维持运动协调和痛觉调节具有重要生理意义。在部分神经突触中，甘氨酸与γ-氨基丁酸协同产生抑制作用。
在大脑皮层等高级中枢区域，甘氨酸可能通过N-甲基-D-天冬氨酸受体发挥兴奋性调节作用。作为该受体的共激动剂，甘氨酸能增强谷氨酸的神经传递效应，参与学习记忆等高级神经功能。这种双重作用与其作用部位及受体亚型的差异分布密切相关。
对于神经系统功能研究，建议通过电生理检测、受体拮抗剂实验等方法明确特定神经通路中甘氨酸的递质性质。在涉及神经递质相关疾病的诊疗中，应在神经科医生指导下进行针对性检查，避免自行推断神经递质功能状态。