原矿朱砂作为中药材，在传统中医理论中具有镇心安神、清热解毒、明目、消肿止痛以及外用敛疮等功效。其药用价值主要体现在矿物药的特殊性质上，但需严格遵循医嘱使用，避免汞中毒风险。
1、镇心安神
朱砂色赤入心经，中医认为其重镇之性可安定神志，适用于心火亢盛所致的心悸、失眠、惊痫等症状。古代方剂如朱砂安神丸便以此为主药，通过抑制中枢神经兴奋性发挥作用。
2、清热解毒
其性微寒可清解热毒，常用于温热病引起的高热烦躁、神昏谵语等症。现代研究显示硫化汞成分对部分病原微生物有抑制作用，但临床已较少内服应用。
3、明目
针对肝火上炎导致的目赤肿痛、视物模糊，可配伍菊花、决明子等药物。使用时多研磨成极细粉末，通过外敷或微量入丸散发挥作用，但直接接触眼部存在风险。
4、消肿止痛
外用于疮疡肿毒时，可配伍雄黄、冰片制成散剂。其收敛特性有助于缓解局部红肿热痛，但开放性伤口禁用，且需控制使用时长防止汞蓄积。
5、外用敛疮
对久不收敛的溃疡、湿疹，可制成低浓度膏剂促进创面干燥。需注意创面需彻底清创后使用，避免与碘化物、溴化物等发生化学反应生成有毒物质。
需要特别注意的是，朱砂主要成分为硫化汞，现代医学证实其具有神经毒性和肝肾毒性。国家药典规定朱砂日用量不得超过0.5克，且不宜长期使用。孕妇、肝肾功能不全者禁用，外用时应避开黏膜部位。临床使用已逐渐被更安全的药物替代，如需使用必须在中医师指导下严格掌握适应症和用法用量。