会厌囊肿手术的风险通常不大，属于相对安全的微创手术。手术多采用支撑喉镜下切除术，创伤较小且术后恢复较快。但具体风险程度需结合个人情况综合评估，多数患者在规范操作下预后良好。
会厌囊肿手术的常见风险包括术后感染、局部出血以及麻醉相关并发症。感染多因术后护理不当引起，表现为切口红肿或疼痛加剧；出血通常较少见，可能与术中操作或血管处理有关。此外，全身麻醉本身存在呼吸道痉挛、心率异常等潜在风险，但发生率较低。对于位置特殊的囊肿或体积较大者，术中可能增加周围组织损伤的概率，不过经验丰富的耳鼻喉科医生能有效规避这类风险。
选择正规医疗机构进行手术至关重要，术前需完善喉镜、CT等检查明确囊肿范围。术后应严格遵循禁声、流质饮食等医嘱，定期复查喉镜观察恢复情况。若出现持续发热、呼吸困难或咯血等症状，需立即返院处理。多数患者经规范治疗后囊肿可彻底清除，且不会影响正常吞咽和呼吸功能。