B12和甲钴胺并不属于同一种药物，但甲钴胺是维生素B12在体内的活性形式之一。维生素B12是一个总称，涵盖多种钴胺素类物质，而甲钴胺是其中可直接参与人体代谢的衍生物。
1、化学结构差异
维生素B12主要包括氰钴胺、羟钴胺、腺苷钴胺和甲钴胺等类型。甲钴胺的分子结构中含有一个甲基基团，而其他形式如氰钴胺则含有不同的功能基团，导致其代谢途径和生物利用度存在差异。
2、代谢过程不同
普通维生素B12（如氰钴胺）进入人体后需在肝脏转化为甲钴胺或腺苷钴胺才能发挥作用。而甲钴胺无需经过生物转化，可直接参与体内甲基转移反应和神经髓鞘合成，因此对神经系统疾病的治疗效果更直接。
3、临床应用区别
甲钴胺主要用于周围神经病变（如糖尿病神经病变）、巨幼红细胞性贫血的治疗。而普通维生素B12制剂更多用于营养缺乏性疾病的预防和纠正，例如长期素食者或胃肠吸收障碍患者的补充治疗。
4、副作用差异
甲钴胺因无需代谢转化，药物相互作用相对较少。而氰钴胺在代谢过程中可能产生微量氰化物，对于肝肾功能不全者需谨慎使用，长期大剂量使用存在潜在风险。
这两种药物均需在医生指导下使用。对于周围神经病变患者，甲钴胺通常是首选；而普通维生素B12更多用于营养补充。具体用药选择需根据患者的疾病类型、代谢能力及实验室检查结果综合判断，不建议自行替换使用。