口腔HPV感染通常可以挂口腔科、皮肤性病科或感染科，具体需根据症状表现及就诊医院科室设置选择。若以口腔内病损为主，建议优先到口腔科就诊；若伴随其他部位症状，可考虑皮肤性病科或感染科。
1、口腔科
口腔HPV感染常表现为口腔黏膜的疣状增生、溃疡或异常斑块。口腔科医生可通过视诊、触诊判断病变范围，必要时取活检进行病理检查，明确是否为HPV感染及分型，同时排查癌变风险。对于局限于口腔的病灶，口腔科可提供冷冻、激光等局部治疗。
2、皮肤性病科
当口腔HPV感染合并生殖器、肛门等部位尖锐湿疣时，皮肤性病科可对全身皮肤黏膜病变进行系统评估。该科室擅长HPV相关疾病的综合治疗，包括药物治疗（如咪喹莫特乳膏）、物理治疗及免疫调节治疗，并能指导预防传播。
3、感染科
对于免疫功能低下者出现广泛HPV感染或反复发作的情况，感染科可进行病毒载量检测、免疫功能评估等系统检查，制定抗病毒治疗方案。该科室还负责鉴别是否合并其他机会性感染，尤其适用于HIV感染者等特殊人群。
建议就诊时携带既往检查报告，如实告知病史及接触史。早期规范治疗可有效控制病情发展，日常需避免口腔黏膜损伤、减少烟酒刺激，并注意性行为防护以降低传染风险。