整肠生和益生菌在定义、菌种类型及适用范围等方面存在区别，通常不能一概而论。整肠生属于特定益生菌制剂，而益生菌是包含多种有益菌的统称，需根据个体情况选择。
1、定义区别
整肠生是药品名称，通用名为地衣芽孢杆菌活菌胶囊，属于单一菌种的微生态制剂。益生菌则是泛指对人体有益的活性微生物总称，包含双歧杆菌、乳酸菌等多种菌属，既包含药品也涵盖保健品类别。
2、菌种类型区别
整肠生主要成分是地衣芽孢杆菌，通过消耗肠道内氧气促进厌氧菌生长。普通益生菌制剂可能含有乳杆菌、酪酸梭菌或布拉氏酵母菌等不同菌种，不同菌株对肠道环境的作用机制存在差异。
3、适用范围区别
整肠生多用于细菌或真菌引起的急慢性肠炎、腹泻，也可辅助治疗其他消化道菌群失调。普通益生菌适用范围更广，包括改善便秘、增强免疫力或缓解乳糖不耐受，具体功效因所含菌株而异。
使用益生菌制剂前需明确自身症状类型，整肠生作为药品需严格遵医嘱使用。避免与抗菌药物同时服用，必要时需间隔2小时以上，以免影响活菌疗效。储存时注意避光防潮，确保菌株活性。