青霉素与红霉素眼药膏的区别主要体现在药物类别、抗菌谱、适应症等方面，二者均属于抗生素类眼用制剂，但具体作用特点不同。
青霉素眼药膏主要成分为青霉素钠或青霉素钾，属于β-内酰胺类抗生素，其抗菌谱主要针对革兰氏阳性菌如溶血性链球菌、肺炎链球菌等。由于青霉素类药物易引发过敏反应，且金黄色葡萄球菌对其耐药性较高，目前在眼科临床使用较少。红霉素眼药膏属于大环内酯类抗生素，抗菌谱覆盖革兰氏阳性菌及部分革兰氏阴性菌，对衣原体、支原体等非典型病原体也有抑制作用，常用于治疗沙眼、结膜炎等眼部感染。
从应用范围来看，红霉素眼药膏的适应症更广泛，除治疗细菌性结膜炎外，还可用于预防新生儿淋球菌性眼炎。而青霉素眼药膏因耐药性问题，在眼科多用于特定敏感菌引起的感染。两者均为油性基质眼膏，但红霉素眼药膏过敏反应发生率较低，使用安全性相对较高。
使用这两种药物前需经眼科医生诊断，青霉素类药物使用前必须进行皮试，确认无过敏反应方可使用。眼部用药期间若出现红肿加剧或视力变化，需立即停药并就诊。抗生素眼膏不宜长期使用，以免导致耐药菌滋生或真菌感染。