巧克力囊肿一般不能自愈，可以通过饮食调理、运动锻炼、药物治疗、激光治疗、手术治疗等方式进行治疗，需要注意积极的配合医生治疗。
1.饮食调理
患者在平时可以适当食用新鲜的蔬菜和水果，比如胡萝卜、苹果等，能够帮助补充人体内所需要的营养成分，有助于改善身体状态。
2.运动锻炼
比如慢跑、快走、游泳等，可以帮助促进人体内的代谢，维持体重平衡，对于病情控制有积极的作用。
3.药物治疗
可以在医生的指导下使用屈螺酮炔雌醇片、去氧孕烯炔雌醇片、地屈孕酮片等药物进行治疗，能够帮助抑制卵巢功能，减少雌激素分泌，而且还能够抑制囊肿生长。
4.激光治疗
遵医嘱进行激光治疗，能够帮助改善颈部血液循环，促进炎症消退，有利于减轻不适症状。
5.手术治疗
如果患者的病情比较严重，可在专业医生的操作下通过腹腔镜手术、开腹手术等方式进行治疗，能够帮助切除囊肿或者病变组织。
在日常生活中，患者要注意放松心情，保持积极向上的心态，避免出现紧张以及焦虑的情绪。此外，也需要注意保持规律的作息，避免过度劳累。