流脑和乙脑在病原体、传播途径、症状表现等方面存在明显区别。流脑是由脑膜炎奈瑟菌引起的细菌感染，乙脑则由乙型脑炎病毒导致，两者病因不同。流脑通过呼吸道飞沫传播，乙脑主要通过蚊虫叮咬传播。
1、病原体不同
流脑由脑膜炎奈瑟菌感染引起，属于细菌性疾病；乙脑由乙型脑炎病毒引起，属于病毒性传染病。病原体差异决定了治疗方式的区别，流脑需使用抗生素，而乙脑无特效抗病毒药物。
2、传播途径不同
流脑主要通过感染者咳嗽、打喷嚏产生的飞沫传播，具有人际传染性；乙脑通过携带病毒的蚊虫叮咬传播，属于虫媒传染病，人与人之间不会直接传播。
3、症状表现不同
流脑起病急骤，表现为高热、剧烈头痛、频繁呕吐，特征性症状为皮肤瘀点瘀斑及颈项强直；乙脑以持续高热、意识障碍、抽搐为典型表现，重症可能遗留神经系统后遗症如瘫痪、智力障碍等。
4、治疗方法不同
流脑需尽早使用头孢曲松、青霉素等敏感抗生素治疗；乙脑主要采取降温、止痉、脱水降颅压等对症支持治疗，必要时需机械通气维持生命体征。
5、预防措施不同
两者均有疫苗可预防，但流脑疫苗为多糖疫苗，乙脑疫苗为减毒活疫苗。乙脑还需加强防蚊灭蚊措施，流脑需注意呼吸道隔离防护。
若出现高热伴神经系统症状，应及时到感染科就诊并进行腰椎穿刺检查以明确诊断。确诊后需严格遵循医嘱进行治疗，两种疾病均属于法定传染病，需按规定进行疫情报告和隔离管理。日常应注意按时接种相关疫苗以建立免疫屏障。