黄芪和黄芩的区别主要体现在来源、性味归经以及功效作用等方面，两者虽名称相近但属于不同中药。黄芪是豆科植物蒙古黄芪或膜荚黄芪的干燥根，黄芩则为唇形科植物黄芩的干燥根，需注意区分。
1、来源不同
黄芪来源于豆科植物蒙古黄芪或膜荚黄芪的根部，主产于山西、内蒙古等地，外观呈圆柱形，表面淡棕黄色。黄芩来源于唇形科植物黄芩的根部，主产于河北、山西等地，根部常扭曲，表面棕黄色或深黄色。
2、性味归经不同
黄芪性微温，味甘，归脾、肺经，具有补气升阳的作用。黄芩性寒，味苦，归肺、胆、脾、胃、大肠经，以清热燥湿为主要功效。两者药性一温一寒，作用方向相反。
3、功效作用不同
黄芪侧重补气固表，适用于气虚乏力、食少便溏、中气下陷等症，可改善体虚自汗，促进疮疡溃后愈合。黄芩长于清热泻火，常用于湿热痞满、肺热咳嗽、高热烦渴等实热证，对血热吐血、胎动不安也有疗效，现代研究显示其含黄芩苷等成分具有抗菌作用。
使用时需根据体质和证型选择，阴虚阳亢者慎用黄芪，脾胃虚寒者慎用黄芩。两者均可煎服或入丸散，但具体用法用量应经中医师辨证后指导，避免自行配伍使用，以免药性冲突或加重病情。