经颅磁刺激治疗在规范操作下通常不会导致病情加重，但部分患者可能因个体差异或操作不当出现不适反应。该治疗的安全性主要与操作规范性、患者自身情况等因素相关。
1、规范操作下的安全性
经颅磁刺激治疗属于非侵入性物理疗法，在参数设置合理、定位准确的情况下，通常不会引起严重不良反应。部分患者可能在治疗后出现短暂头皮不适、头痛等，但这些症状多数可自行缓解，不会造成长期影响。
2、操作不当的风险
若治疗参数设置过高、刺激频率不当或刺激部位偏移，可能诱发耳鸣、头晕等症状。极少数情况下不恰当的刺激可能引起局部肌肉抽搐，但通过及时调整治疗参数即可有效控制。
3、患者自身因素影响
存在癫痫病史、脑部金属植入物等禁忌症患者，或对磁刺激特别敏感的人群，可能出现异常神经反应。治疗前完善的禁忌症筛查和个性化方案制定，可显著降低相关风险。
进行经颅磁刺激治疗时，需选择具有资质的医疗机构，由专业医生评估适应症并制定治疗方案。治疗过程中出现任何异常感知或不适，应及时向操作医师反馈。治疗后注意观察身体反应，避免短期内重复接受高强度磁刺激。