生殖器疣的治疗方法主要包括药物治疗、物理治疗、手术治疗、免疫治疗以及中药辅助治疗等，需根据疣体大小、位置及患者情况选择合适方案。建议患者尽早就医，由医生制定个体化治疗方案。
1、药物治疗
可遵医嘱局部外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊或5-氟尿嘧啶软膏等。这类药物通过抑制病毒复制或促进疣体坏死脱落发挥作用，适用于较小疣体或特殊部位病灶，需严格按疗程使用，避免损伤周围正常皮肤。
2、物理治疗
二氧化碳激光、液氮冷冻是常用手段。激光通过高温气化疣体组织，冷冻则利用低温使细胞坏死，适用于直径小于1cm的疣体，治疗后需注意创面护理，防止继发感染。
3、手术治疗
对于体积较大（直径超过1cm）、带蒂生长的疣体，可采用手术切除或高频电刀治疗。术后需进行病理检查确认病变性质，该方法见效快但可能遗留瘢痕。
4、免疫治疗
干扰素局部注射或口服免疫调节剂，适用于反复发作或广泛分布的患者。通过增强机体细胞免疫功能抑制HPV病毒活性，常需配合其他疗法联合使用。
5、中药治疗
可在医生指导下使用清热解毒类中药外洗，如板蓝根、大青叶煎剂，但不可替代主流疗法。需注意避免使用腐蚀性强的偏方，防止造成皮肤溃烂。
治疗期间应保持患处清洁干燥，避免搔抓导致病毒扩散。建议性伴侣同时接受检查，治疗后每3个月复查HPV病毒载量。治疗期间需严格使用避孕套，完全治愈前禁止无保护性行为。若出现疣体短期内快速增大、出血或基底硬化等情况，应及时进行病理活检排除恶变可能。