慈菇作为传统中药材，一般具有清热解毒、润肺止咳、散结消肿、利尿通淋以及凉血止血等药用价值。其药用部位主要为球茎，需在中医理论指导下合理应用。
1、清热解毒
慈菇性微寒味甘苦，归肺经与肝经，能清除体内热毒。中医常用于治疗热毒引起的疮疡肿痛，其含有的生物活性成分可辅助抑制炎症反应。
2、润肺止咳
其滋阴润燥的特性可缓解肺燥引起的干咳少痰。对于秋季燥邪伤肺或阴虚肺热导致的咽喉不适，可配伍麦冬、百合等药材使用。
3、散结消肿
慈菇具有软坚散结的功效，对瘰疬结核、乳腺增生等结块性疾病有辅助治疗作用。临床常与夏枯草、浙贝母等配伍应用。
4、利尿通淋
能促进水液代谢，改善小便不利等症状。对于湿热下注引起的尿频尿急，可配合车前草等利水渗湿药使用。
5、凉血止血
其收敛特性有助于缓解血热妄行引起的鼻衄、轻度外伤出血。外用时可将鲜品捣敷患处，内服需配伍其他止血药材。
需要注意的是，慈菇含有秋水仙碱等生物碱成分，不宜过量食用。孕妇、脾胃虚寒者应慎用，使用前建议咨询中医师辨证施治。日常应用中应注意区分药用与食用剂量差异，避免自行采挖不明来源的野生品种。