百香果一般可以直接吃。成熟的百香果果肉酸甜可口，含有丰富的维生素C、膳食纤维以及多种矿物质，但需注意正确的食用方式和适量原则，避免过量或误食果皮引发不适。
百香果的食用部位是内部的黄色果肉和黑色种子，果皮较硬且含有较多纤维，通常不建议食用。成熟果实的果肉可直接用勺子挖取，或兑水稀释后饮用。若果实未完全成熟，果肉酸度较高可能刺激口腔和胃肠道。部分人群可能对百香果中的果酸或果胶过敏，食用后可能出现皮疹、腹泻等过敏反应。
日常建议选择表皮皱缩的成熟百香果，切开后果肉呈深黄色为佳。食用后可用清水漱口减少酸性物质对牙齿的侵蚀。若首次尝试可少量食用观察身体反应，出现腹痛、瘙痒等症状需立即停止并就医。储存时应置于阴凉通风处，避免潮湿环境导致霉变。