黄连素对咽炎可能有一定帮助，但一般不建议作为主要治疗药物。其具体效果需结合咽炎类型及病情严重程度进行综合判断。
黄连素的主要成分是小檗碱，具有广谱抗菌作用，对部分细菌性咽炎可能产生抑制效果。但由于咽炎多由病毒或细菌感染引起，且病变部位位于咽喉黏膜，口服黄连素后局部药物浓度有限，难以直接作用于病灶区域。对于急性细菌性咽炎，临床通常首选阿莫西林、头孢克肟等抗生素；病毒性咽炎则以对症治疗为主，常用复方氯己定含漱液、西瓜霜含片等局部药物缓解症状。
若伴随肠道感染症状，黄连素可能通过调节肠道菌群间接改善全身炎症状态。但需注意，长期使用可能影响正常肠道功能。出现咽痛、吞咽困难等症状时，建议及时耳鼻喉科就诊，通过咽拭子培养明确病原体类型，在医生指导下选择雾化吸入、局部理疗等针对性治疗方案。