五子衍宗丸作为中成药，可能引起胃肠道不适、过敏反应、肝肾功能异常、药物相互作用以及特殊人群不良反应等副作用。其不良反应的发生概率和严重程度通常与个体差异、用药剂量及疗程有关。
1、胃肠道不适
部分患者在服用五子衍宗丸后可能出现恶心、腹胀、食欲减退等症状。这是由于药物成分对胃肠黏膜产生刺激作用，或患者本身存在脾胃虚弱的情况。一般症状较轻时可调整用药时间或在饭后服用以缓解。
2、过敏反应
偶见皮肤瘙痒、红疹或荨麻疹等过敏表现，可能与个体对药物中某些成分敏感有关。严重时可能出现血管神经性水肿，需立即停药并就医进行抗过敏治疗。
3、肝肾功能异常
长期大剂量服用可能增加肝肾代谢负担，特别是原有肝肾疾病的患者，可能出现转氨酶升高或肌酐水平异常。用药期间建议定期监测肝肾功能指标。
4、药物相互作用
与免疫抑制剂、强心苷类药物联用时可能影响药效，与利尿剂合用可能加重电解质紊乱。合并用药时应间隔至少1小时以上，并告知医生正在使用的药物。
5、特殊人群反应
孕妇服用可能影响胎儿发育，哺乳期妇女用药后部分成分可能通过乳汁分泌。儿童脏腑娇嫩，易出现性早熟等内分泌紊乱现象，此类人群应严格遵医嘱使用。
服用五子衍宗丸期间若出现不适症状，应及时停药观察。需注意避免与辛辣刺激食物同服，服药两周后症状未改善应复诊调整方案。特殊体质患者建议在中医师指导下辨证使用，不可自行延长疗程或增加剂量。