牛黄清胃丸作为中成药，其主要功效为清胃泻火、润燥通便，常用于缓解胃火炽盛引起的口舌生疮、牙龈肿痛等症状，但该药的主要作用机制并非直接保护胃黏膜。
牛黄清胃丸中的黄芩、栀子等成分具有清热燥湿的功效，可通过减轻胃部炎症反应间接减少对黏膜的刺激。对于因胃火亢盛导致胃痛、灼热感的患者，其泻火作用可能降低胃酸分泌异常升高的风险。但需注意，其组方中缺乏胶体铋剂、硫糖铝等明确的胃黏膜保护成分，无法像铝碳酸镁等药物直接形成物理屏障。
现有临床研究多集中于该药对实热证的治疗效果，尚无权威证据表明其对胃黏膜损伤具有修复作用。若存在糜烂性胃炎、胃溃疡等黏膜损伤性疾病，建议遵医嘱使用奥美拉唑、康复新液、瑞巴派特等具有明确黏膜修复作用的药物。
使用牛黄清胃丸需严格辨证，适用于舌红苔黄、便秘尿赤等实热证候人群。用药期间应避免辛辣刺激饮食，若出现胃部隐痛、泛酸等黏膜损伤症状加重，应及时停药并就诊。胃黏膜保护需结合具体病因，在医生指导下制定个性化治疗方案。