EB病毒感染通常可以自愈，但具体是否能够自愈需根据患者的免疫状态及是否出现并发症而定。多数免疫力正常的患者可通过自身免疫系统清除病毒，但免疫力低下或出现并发症时需积极治疗。
EB病毒感染属于疱疹病毒科，大部分患者表现为传染性单核细胞增多症，常见症状包括发热、咽痛和淋巴结肿大。对于免疫功能正常的人群，该病具有自限性，一般4-6周内症状可自行缓解，无需特殊抗病毒治疗。病程中可通过充分休息、补充水分等支持疗法帮助恢复。
若患者存在免疫功能缺陷，如艾滋病、器官移植术后或先天性免疫缺陷，病毒可能持续复制并引发严重并发症，例如噬血细胞综合征或慢性活动性EB病毒感染。此时需在医生指导下使用更昔洛韦、膦甲酸钠等抗病毒药物，必要时需进行免疫调节治疗。部分EB病毒感染相关的恶性肿瘤如鼻咽癌，需通过放化疗等综合手段干预。
EB病毒感染后应密切观察体温、淋巴结肿大程度等病情变化。若出现持续高热超过2周、肝脾进行性肿大或神经系统症状，应立即就诊。日常需保证营养均衡，避免过度劳累，免疫力低下者需定期复查病毒载量。