甲氧氯普胺的常见副作用主要包括中枢神经系统反应、消化系统不适、内分泌系统影响、心血管系统异常以及过敏反应等。具体表现因人而异，需根据个体情况观察。
1、中枢神经系统反应
甲氧氯普胺可能通过血脑屏障作用于多巴胺受体，部分患者会出现嗜睡、头晕或乏力。少数长期大剂量使用者可能出现锥体外系症状，如肢体震颤、肌肉僵硬或面部表情异常，这与药物对基底节多巴胺受体的阻断作用相关。
2、消化系统不适
该药物可能过度增强胃肠蠕动，导致约10%-20%患者出现腹泻或腹部绞痛。另有部分患者因胃肠功能紊乱反而出现便秘，通常与个体肠道敏感度差异有关，症状多出现在用药初期。
3、内分泌系统影响
药物可刺激垂体前叶分泌催乳素，约5%患者可能出现乳房胀痛、溢乳现象。女性患者可能出现月经周期紊乱，男性可能伴随性欲减退，这些变化通常在停药后2-3周逐渐恢复。
4、心血管系统异常
偶见患者出现体位性低血压，尤其在快速改变体位时易发生。少数病例报告显示可能出现窦性心动过缓，老年患者或原有心脏疾病者发生率相对较高，可能与药物对心肌电生理的影响有关。
5、过敏反应
约1%-3%患者用药后出现皮肤红斑、荨麻疹等速发型过敏反应。极少数可能发生血管神经性水肿，多出现在首次用药后30分钟内，与个体免疫系统对药物成分的异常应答相关。
使用甲氧氯普胺期间应密切观察身体反应，若出现肌肉痉挛、呼吸困难或严重心律失常等表现，应立即停药并就医。用药期间避免驾驶或操作精密仪器，有帕金森病史或肾功能不全者需提前告知医生。建议遵医嘱控制用药剂量和疗程，不得自行延长治疗时间。