阿莫罗芬搽剂主要用于治疗甲真菌感染，并非头癣的首选治疗药物。头癣属于毛发和头皮的浅部真菌感染，其治疗通常需要系统性抗真菌药物与局部治疗相结合。
头癣的病原菌以皮肤癣菌为主，如毛癣菌属，其感染部位涉及毛囊深处。阿莫罗芬搽剂作为吗啉类抗真菌药，虽然对皮肤癣菌具有体外抗菌活性，但其剂型特性限制了在头癣治疗中的应用：该药物主要成膜剂配方针对甲板渗透设计，难以有效穿透毛发角蛋白及毛囊结构。临床治疗指南推荐口服特比萘芬或伊曲康唑联合外用酮康唑洗剂，这类方案能同时杀灭发干内真菌和清除头皮表面孢子。
对于确诊头癣的患者，建议在皮肤科医生指导下规范使用抗真菌药物。治疗期间需注意个人卫生用品消毒，避免交叉感染，并完成全程治疗以防复发。自行使用非适应症药物可能导致疗效不佳或延误规范治疗。