复方黄连素片一般不作为治疗口腔溃疡的首选药物，但对于部分因细菌感染引起的溃疡可能有一定辅助作用。该药物主要用于肠道感染相关疾病的治疗，口腔溃疡的常规治疗需根据具体病因选择合适方法。
1、抗菌消炎
复方黄连素片主要成分为盐酸小檗碱，具有广谱抗菌作用，对金黄色葡萄球菌等部分口腔常见致病菌可能产生抑制作用。对于细菌感染诱发的口腔溃疡，可能通过抑制病原菌增殖减轻局部炎症反应。
2、辅助止痛
药物中的木香、吴茱萸等成分具有行气止痛功效，可能通过调节局部血液循环缓解溃疡疼痛。但相较于口腔溃疡专用贴膜或喷雾剂，其局部镇痛效果相对有限。
3、调节免疫
白芍成分含有芍药苷等物质，可能通过增强机体免疫功能间接促进溃疡愈合。但该作用需要通过全身吸收发挥，对局部溃疡的直接修复作用较弱。
出现口腔溃疡建议优先选择西地碘含片、重组人表皮生长因子凝胶等局部治疗药物。若使用复方黄连素片治疗，需严格遵医嘱，避免长期大量服用。伴有发热、大面积溃疡或久治不愈者应及时就诊，排查白塞病、癌性溃疡等严重疾病可能。日常应注意保持口腔卫生，避免辛辣刺激性食物，适量补充维生素B族和锌元素。