肠道菌群紊乱可能会引发腹痛。肠道菌群失衡时，可能通过影响消化功能、肠道环境以及免疫反应等机制导致腹部不适，但具体需结合个体情况综合判断。
肠道菌群紊乱时，有害菌过度增殖可能产生大量气体和毒素，刺激肠道黏膜引发痉挛性疼痛。同时，部分有益菌数量减少会导致食物分解不充分，未完全消化的物质堆积在肠道内，进一步加重胀气和绞痛感。此外，菌群失衡可能诱发肠道低度炎症，释放炎性介质直接刺激痛觉神经末梢。
若腹痛伴随腹泻、便秘交替或排便习惯改变，可能与肠易激综合征相关，这类患者常存在肠道菌群多样性下降。对于长期使用抗生素者，菌群失调导致产气荚膜杆菌等致病菌增殖，可能引发腹部绞痛伴水样便。部分研究显示，补充特定益生菌如双歧杆菌可改善此类腹痛。
出现持续腹痛建议及时消化科就诊，通过粪便菌群检测明确失调类型。日常需保持规律饮食，增加膳食纤维摄入量，避免滥用抗生素。若确诊菌群失调，应在医生指导下选择合适益生菌制剂，不宜自行长期服用保健品。