高锰酸钾对脚气有一定的辅助治疗效果，但通常不能作为主要治疗手段。脚气主要由皮肤癣菌感染引起，治疗需以抗真菌药物为主，高锰酸钾可通过其氧化性发挥局部抗菌和收敛作用。
高锰酸钾为强氧化剂，其稀释溶液可释放活性氧，破坏微生物结构，对细菌、真菌等有一定抑制效果。对于脚气伴随的糜烂、渗出等症状，0.01%-0.02%浓度溶液浸泡可帮助清洁创面、减少分泌物。但皮肤癣菌常深藏在角质层，高锰酸钾难以彻底杀灭病原体，过度使用还可能造成皮肤干燥、染色等不良反应。
临床治疗脚气首选外用抗真菌药，如联苯苄唑乳膏、硝酸咪康唑散、特比萘芬喷雾剂等，这些药物能针对性抑制真菌细胞膜合成。若合并细菌感染，可短期配合使用莫匹罗星软膏。建议保持足部干燥通风，每日更换棉质袜，避免与他人共用鞋袜。脚气反复发作或症状严重者，需在皮肤科医生指导下进行真菌镜检并规范用药，不宜自行长期使用高锰酸钾溶液。