木瓜含有丰富的维生素、矿物质及木瓜蛋白酶等营养成分，直接食用或合理搭配其他食材有助于提升其营养价值。通常可以通过直接食用、搭配牛奶或酸奶、制作炖品等方式来更营养地食用木瓜。
1、直接食用
新鲜成熟的木瓜去皮去籽后可直接食用，能最大限度保留其中的维生素C、胡萝卜素及膳食纤维。木瓜中的天然酶类成分如木瓜蛋白酶，有助于促进蛋白质分解，但需注意避免空腹大量食用，以免刺激胃肠道。
2、搭配牛奶或酸奶
将木瓜切块后与牛奶、酸奶混合食用，可提高蛋白质和钙的摄入量。木瓜中的维生素A、C与乳制品中的脂肪结合，有助于脂溶性维生素的吸收。但乳糖不耐受人群建议选择无乳糖产品。
3、制作木瓜炖品
将木瓜与银耳、红枣、雪蛤等食材炖煮，适合消化功能较弱的人群。炖煮过程中木瓜的纤维会被软化，更易吸收，但需控制糖分添加量，糖尿病患者建议选择代糖或无糖配方。
建议每日食用量控制在200-300克，避免过量引起腹泻。未成熟的青木瓜含有较多番木瓜碱，需彻底加热煮熟后食用。特殊人群如孕妇、过敏体质者食用前建议咨询医生，若出现皮疹、腹泻等不适需及时就诊。