胃肠功能紊乱通常可以通过规范治疗和日常调理达到临床治愈的效果，但具体效果因人而异。多数患者在消除诱因、调整生活方式后症状可明显改善，部分患者可能因慢性病因或反复诱因导致症状波动。
1、可治愈的情况
若胃肠功能紊乱由短期精神压力、饮食不当或急性感染诱发，在及时进行心理疏导、改善饮食习惯或抗感染治疗后，多数患者胃肠功能可恢复正常。例如使用双歧杆菌三联活菌胶囊调节肠道菌群，配合雷贝拉唑钠肠溶片缓解胃部不适，症状通常会在4-8周内显著缓解。
2、易反复的情况
对于存在长期焦虑抑郁、肠易激综合征基础病变或器质性胃肠疾病的患者，症状可能呈现周期性发作特点。这类患者需要持续进行认知行为治疗，同时联合马来酸曲美布汀片调节胃肠动力，并定期复查胃肠镜监测病情变化。
建议患者建立规律的作息和饮食制度，每日进行30分钟有氧运动改善植物神经功能。治疗期间需严格遵医嘱用药，避免自行停用黛力新等调节神经药物。若症状持续超过3个月或伴随体重下降，应及时复查排除器质性疾病。