盐酸米诺环素胶囊一般可以用于治疗细菌感染引起的结膜炎，但需在医生指导下使用。结膜炎的治疗方法需根据具体病因选择，常见类型包括细菌性、病毒性、过敏性结膜炎等。
细菌性结膜炎多由金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等致病菌引起，表现为眼部分泌物增多、结膜充血等症状。此时可遵医嘱使用盐酸米诺环素胶囊等抗生素药物，但临床更常用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等局部药物进行针对性治疗。病毒性结膜炎主要由腺病毒、疱疹病毒等引起，需使用更昔洛韦滴眼液等抗病毒药物。过敏性结膜炎则需要使用奥洛他定滴眼液、色甘酸钠滴眼液等抗过敏药物。
使用盐酸米诺环素胶囊需注意该药物属于四环素类抗生素，可能引起胃肠道反应、光敏性皮炎等副作用。8岁以下儿童、孕妇及哺乳期妇女禁用，长期使用可能导致菌群失调或耐药性。若出现视力下降、眼痛加重或用药3天后无改善，应立即停用并就诊眼科进行分泌物细菌培养等检查。治疗期间应避免佩戴隐形眼镜，保持眼部清洁，防止交叉感染。