安全期同房存在一定的怀孕风险，虽然几率较低，但并不能完全排除。由于个体差异和多种因素影响，安全期避孕并非绝对可靠。
月经周期不规律可能导致安全期计算偏差。若女性月经周期波动较大，排卵时间可能提前或延后，此时安全期预测的准确性下降。例如原本预计的“安全期”可能恰逢实际排卵期，从而增加受孕可能性。此外，部分女性可能因情绪、压力或疾病等因素出现额外排卵，即使处于理论安全期也可能意外怀孕。
精子在女性生殖道内可存活3-5天，这会延长受孕窗口期。若在安全期后期发生性行为，而女性提前排卵，存活的精子仍可能成功受精。因此，安全期避孕需要严格计算排卵期，并结合基础体温测量、宫颈黏液观察等方法提高准确性。
建议将安全期避孕与其他避孕方式（如避孕套）结合使用以降低风险。若出现月经延迟或其他妊娠征兆，应及时进行早孕检测。对于需要高效避孕的人群，更推荐使用短效避孕药、宫内节育器等医学避孕方法。