艾草治疗湿疹的安全性需视具体情况而定，一般不能完全替代正规治疗。部分人群可能通过艾草外洗或熏蒸暂时缓解瘙痒，但疗效缺乏足够临床证据支持，且存在一定风险。
艾草含有挥发油及黄酮类物质，体外实验显示其可能具有抗炎作用，但人体皮肤渗透性和实际效果尚不明确。湿疹患者皮肤屏障功能受损，使用浓度不当可能导致刺激性皮炎。约3%-5%的过敏体质人群接触艾草后会出现红斑、丘疹等接触性皮炎表现。临床常见因自行使用艾草导致湿疹加重的案例，特别是婴幼儿及皮肤敏感者更易发生不良反应。
使用前建议进行皮肤斑贴试验，将艾草煎煮液涂抹于前臂内侧，观察24小时无异常再小面积使用。治疗期间应继续使用医生处方的糖皮质激素软膏、钙调磷酸酶抑制剂等正规药物，保持皮肤湿润，避免过度清洁。若症状持续加重或出现水疱、渗液，应立即停用并就诊皮肤科。