奥利司他作为减肥药物一般不会直接影响内分泌系统，但长期使用可能因营养吸收问题间接产生相关影响。该药物主要通过抑制胃肠道脂肪酶活性，减少脂肪吸收，从而达到控制体重的目的。其作用机制不直接作用于内分泌腺体或激素分泌，因此对内分泌系统的直接影响较小。
奥利司他的主要成分不被人体吸收，仅在肠道局部发挥作用，因此不会干扰甲状腺激素、性激素等内分泌相关物质的合成与代谢。但在长期使用过程中，由于脂肪吸收减少可能影响脂溶性维生素（如维生素A、D、E、K）的吸收，进而可能对钙代谢、凝血功能等与内分泌相关的生理过程产生间接影响。
建议严格遵医嘱控制用药周期，通常连续使用不超过6个月。用药期间需每日补充复合维生素，且服用时间应间隔奥利司他用药至少2小时。若出现月经紊乱、异常疲劳等疑似内分泌相关症状，应及时停药并就诊。肥胖患者的内分泌问题多与代谢综合征相关，在药物治疗的同时，仍需通过饮食控制和运动进行综合管理。