间质瘤的良恶性区分通常需要结合病理学检查、影像学检查和临床表现等综合分析。良性间质瘤和恶性间质瘤在细胞特征、生长方式及生物学行为上存在差异，需通过医学手段明确诊断。
1、病理学检查
病理诊断是区分良恶性的金标准。通过活检或术后标本的显微镜观察，若发现肿瘤细胞核分裂象活跃、细胞异型性明显、Ki-67增殖指数较高（如超过10%）或存在坏死灶，往往提示恶性倾向。免疫组化检测中CD117、DOG-1等标志物阳性有助于确诊胃肠间质瘤，但需结合形态学特征判断恶性程度。
2、影像学检查
CT或MRI可显示肿瘤大小、边界及浸润情况。良性间质瘤通常直径小于5厘米，边界清晰且无周围组织侵犯。恶性间质瘤多表现为体积较大（如超过10厘米）、边缘模糊、内部密度不均，增强扫描可见明显强化，部分伴有邻近器官受压或转移征象。超声内镜对消化道间质瘤的层次结构评估也有重要价值。
3、临床表现
良性间质瘤生长缓慢且症状隐匿，可能仅表现为腹部包块或轻微压迫感。恶性间质瘤常引起消化道出血、肠梗阻、消瘦等明显症状，若出现肝转移或腹腔种植，则更支持恶性诊断。部分患者血液中CD117蛋白水平升高也可作为辅助参考指标。
建议发现间质瘤后及时到普外科或肿瘤科就诊，通过穿刺活检、PET-CT等全面评估。对于难以明确性质的肿瘤，需密切随访观察其生长速度及生物学行为变化，必要时进行手术切除和病理诊断以指导后续治疗。