间质瘤的性质既可能是良性，也可能是恶性或潜在恶性，通常需要结合病理检查结果综合判断。多数胃肠道间质瘤具有潜在恶性倾向，但具体良恶性需通过肿瘤大小、核分裂像及基因检测等评估。
1、潜在恶性或低度恶性
大多数胃肠道间质瘤属于潜在恶性，肿瘤直径大于2厘米且核分裂像超过5/50HPF时，恶性风险显著增加。这类肿瘤生长速度较慢，但存在转移可能性，常见于胃部和肠道，需密切随访观察。
2、明确恶性
约20%-30%的间质瘤表现为明显恶性，肿瘤直径超过5厘米、核分裂像超过10/50HPF时，常伴随出血、坏死及浸润性生长。此类肿瘤易发生肝转移或腹腔种植转移，患者可能出现消化道出血或肠梗阻症状。
3、良性表现
少数小型间质瘤（直径小于2厘米）核分裂像低于5/50HPF时，可能呈现良性生物学行为。这类肿瘤多通过体检发现，生长缓慢且无转移倾向，但仍有发展为恶性的潜在风险。
发现间质瘤应及时到正规医院肿瘤科就诊，通过超声内镜、CT等影像学检查结合病理活检明确性质。确诊后应根据肿瘤部位、大小及基因检测结果制定个体化治疗方案，包括手术切除或靶向药物治疗，切勿因肿瘤体积小忽视定期复查。