黑蒜通常能在一定程度上改善消化功能，但其效果因人而异。黑蒜中含有大蒜素、氨基酸以及膳食纤维等成分，可能通过促进消化液分泌或调节肠道菌群来辅助消化。但需注意，过量食用可能引发胃肠不适。
黑蒜中的大蒜素具有刺激性气味和活性成分，可能促进胃酸和消化酶的分泌，从而帮助分解食物中的蛋白质和脂肪。此外，黑蒜在发酵过程中产生的低聚果糖属于可溶性膳食纤维，可作为益生元促进肠道有益菌群的增殖，间接改善肠道蠕动功能。部分研究显示，其含有的硫化物还可能缓解胃肠道炎症反应。
对于存在慢性胃炎或胃溃疡的人群，黑蒜的刺激性成分可能加重胃黏膜损伤，导致反酸、烧心等症状。胃肠功能较弱者建议从少量开始尝试，观察身体反应。若出现腹泻、腹痛等异常情况需立即停止食用。
日常饮食中可将黑蒜作为调味辅料适量添加，但不宜替代正规治疗。若长期存在消化不良、腹胀等问题，建议及时就医排查是否存在幽门螺杆菌感染或器质性疾病，并在医生指导下进行针对性治疗。