CT检查使用的X射线确实会产生电离辐射，但常规检查的辐射剂量通常控制在安全范围内。现代CT设备通过优化扫描方案，能够有效降低辐射暴露量。
辐射剂量与检查部位和扫描模式密切相关。头颅CT辐射量约为2mSv，相当于自然环境8个月的本底辐射；胸部CT约为7mSv，相当于2年本底辐射。婴幼儿、孕妇等敏感人群接受检查时，放射科技师会采用铅围脖、铅围裙等防护设备重点保护甲状腺、性腺等辐射敏感器官。对于育龄期女性，检查前需确认未怀孕。
医疗机构遵循辐射防护最优化原则，只有当临床获益明显大于潜在风险时才会建议进行CT检查。检查后可通过多饮水促进代谢，日常注意均衡饮食补充抗氧化营养素。备孕夫妇建议检查后3个月再考虑受孕，以消除生殖细胞受影响的潜在可能。