避孕套一般可以降低性传播疾病的风险，但防护效果受使用方式、病原体类型等因素影响。正确使用避孕套能有效减少部分病原体的传播，但无法完全杜绝感染可能性。
避孕套主要通过物理阻隔体液接触来发挥作用。乳胶材质的避孕套能阻挡约98%的HIV病毒传播，对淋病、衣原体等通过精液或阴道分泌物传播的疾病也有显著防护效果。对于通过皮肤接触传播的病原体如HPV（人乳头瘤病毒）和HSV（单纯疱疹病毒），因避孕套无法完全覆盖生殖器周围皮肤，防护效果会有所下降。梅毒螺旋体可能通过未被避孕套覆盖的皮肤溃疡部位传播，这种情况防护效果也会减弱。
使用过程中需注意全程正确佩戴，避免中途脱落或破裂。选择符合国家质量标准的产品，配合水基润滑剂可降低破损风险。若发生高危性行为或出现不适症状，应及时到正规医疗机构进行相关检测。日常还应结合定期健康检查、固定性伴侣等多种方式综合预防。