克霉唑栓通常不能用于治疗真菌性扁桃体炎。该药物主要用于阴道局部给药，剂型和给药途径均不适合咽喉部位的真菌感染治疗，需根据感染部位选择对应的抗真菌药物。
克霉唑栓的适应症为外阴阴道假丝酵母菌病，其栓剂通过阴道黏膜吸收发挥局部抗真菌作用。而真菌性扁桃体炎属于口咽部念珠菌感染，治疗需采用适宜口腔黏膜给药的剂型，如氟康唑胶囊、伊曲康唑口服液等全身性抗真菌药物，或制霉菌素含片等局部制剂。错误的给药方式可能导致药物无法有效作用于病灶，还可能引发呛咳等不良反应。
若确诊为真菌性扁桃体炎，建议在医生指导下规范治疗。日常需保持口腔清洁，避免滥用抗生素，糖尿病患者需注意控制血糖。治疗期间应避免摄入刺激性食物，定期复查评估疗效，切勿自行使用不对症的药物延误病情。