克霉唑栓一般不用于治疗真菌性肠炎，其治疗效果有限。该药物主要用于阴道或皮肤黏膜的局部真菌感染，而肠道感染需通过全身性抗真菌药物进行针对性治疗。
克霉唑栓属于局部抗真菌药物，其剂型设计是通过阴道或皮肤黏膜吸收发挥抑菌作用。对于肠道深部真菌感染，栓剂的给药途径无法使药物有效渗透至肠黏膜深层。真菌性肠炎通常由念珠菌、曲霉菌等侵袭肠道黏膜引起，需通过口服或静脉给予氟康唑、伏立康唑等全身性抗真菌药物，才能达到足够的血药浓度抑制病原体。
真菌性肠炎常见于免疫功能低下、长期使用广谱抗生素或接受化疗的患者。治疗方案需根据感染菌种及患者免疫状态调整，例如白色念珠菌感染可选用氟康唑胶囊，而曲霉菌感染需使用伏立康唑片或两性霉素B注射液等药物。治疗过程中还需纠正基础疾病，如控制血糖、停用不必要的抗生素等。
若出现慢性腹泻、黏液便伴发热等疑似真菌性肠炎症状，应及时进行粪便真菌培养及肠镜检查。确诊后应在医生指导下规范使用抗真菌药物，避免擅自使用局部栓剂延误病情。治疗期间需定期监测肝肾功能，观察药物不良反应。