消化不良的治疗药物需根据具体病因选择，常见药物包括促胃肠动力药、消化酶制剂、抑酸药等，均需在医生指导下使用。若存在胃酸分泌过多或胃肠蠕动不足等情况，需遵医嘱进行针对性用药。
1、促胃肠动力药
此类药物通过增强胃部肌肉收缩促进胃排空，改善餐后饱胀感，例如莫沙必利片、多潘立酮片、盐酸伊托必利片等。对于功能性消化不良引起的腹胀、嗳气等症状，这类药物可加速胃内容物排入肠道。
2、消化酶制剂
针对胰腺分泌不足或胆汁缺乏导致的脂肪消化障碍，复方消化酶胶囊、胰酶肠溶胶囊、米曲菌胰酶片等药物可补充胰脂肪酶、蛋白酶等成分，帮助分解食物中的蛋白质和脂肪，缓解因消化酶不足引起的食欲不振。
3、抑酸药
对于伴随反酸、烧心等症状的患者，奥美拉唑肠溶胶囊、雷贝拉唑钠肠溶片、兰索拉唑肠溶片等质子泵抑制剂可通过抑制胃酸分泌减轻胃黏膜刺激。这类药物适用于胃食管反流或胃溃疡相关的消化不良。
4、中成药
保和丸、健胃消食片、香砂养胃丸等中成药具有健脾和胃功效，可通过调节胃肠功能改善积食、脘腹胀满等症状，但需经中医辨证后使用。
5、止泻类药物
若消化不良伴随腹泻，蒙脱石散、复方嗜酸乳杆菌片等药物可吸附肠道毒素或调节菌群平衡，而洛哌丁胺胶囊则通过抑制肠蠕动缓解腹泻。
出现消化不良症状时，建议先调整饮食结构，减少油腻及刺激性食物摄入。若症状持续超过1周或伴有呕血、黑便、体重下降等情况，需及时进行胃镜等检查。用药期间需避免同时服用多种作用机制相同的药物，防止加重肝肾负担。孕妇、哺乳期妇女及儿童用药前需严格咨询医师。