小三阳肝炎通常不能自愈，但少数患者可能出现自然缓解。该病属于慢性乙型肝炎病毒感染，病毒在体内长期存在，需要积极治疗控制病情进展。
小三阳肝炎患者体内的乙肝病毒会持续复制并损伤肝细胞，由于病毒DNA可能整合到宿主基因组中，免疫系统难以彻底清除。若未及时干预，部分患者可能逐渐发展为肝纤维化、肝硬化甚至肝癌。虽然极少数患者可能出现表面抗原转阴的自愈现象，但概率极低且无法预测，因此不可寄希望于自愈。
建议患者每3-6个月复查肝功能、乙肝病毒DNA定量和肝脏B超。若符合抗病毒治疗指征，可遵医嘱使用恩替卡韦、替诺福韦等药物抑制病毒复制。日常生活中需严格戒酒，避免熬夜和滥用药物，保持均衡饮食并适当运动，有助于延缓疾病进展。