丝状疣切除术后是否留疤与手术方式、术后护理及个人体质有关，通常规范操作并妥善护理时疤痕风险较低，但若存在感染或瘢痕体质则可能遗留痕迹。
若手术创面较小且愈合顺利，例如采用激光或电灼等精细操作，术后仅形成浅表结痂，待自然脱落后多无明显痕迹。但若术中损伤真皮层较深或术后继发感染，可能因炎症反应刺激胶原过度增生而形成疤痕。此外，瘢痕体质者因基因易感性，即使轻微创伤也可能出现瘢痕疙瘩或增生性瘢痕。
建议选择正规医疗机构进行规范治疗，术后保持创面清洁干燥，避免搔抓、沾水或暴晒。若发现创面红肿渗液、异常增生等表现，需及时复诊处理。多数术后轻微痕迹可通过皮肤修复产品或激光美容逐渐淡化，无需过度焦虑。